L'interface utilisateur de CYPE Cost Estimator est divisée en trois onglets correspondant à chacune des phases de l'avant-projet couvertes par l'application :

• Phase I : Études préliminaires
  L'application demande les données géographiques et économiques relatives au site de l’ouvrage et les données générales du bâtiment. Les résultats obtenus indiquent le montant du budget d’exécution et le coût de construction par m².
• Phase II : Avant-projet sommaire
  L'application demande les caractéristiques typologiques du bâtiment et la configuration des niveaux. Comme sortie de résultats, en plus de ce qui a été indiqué dans la phase I, le budget par chapitres est généré avec un graphique afin de faciliter la visualisation de l'avancement du budget.
• Phase III : Avant-projet détaillé
  Enfin, l'application demande des données plus précises sur les caractéristiques du bâtiment concernant les fondations, la structure, les systèmes constructifs et les installations. Comme sortie de résultats, en plus de ce qui est indiqué dans la phase II, des sous-chapitres sont inclus dans le budget par chapitres.