Dependiendo del programa que se esté utilizando, aparecen los siguientes botones y controles junto a cada componente del árbol:

• Visible
  Permite activar o desactivar la visibilidad de los elementos.
• Modo de visualización
  Permite elegir entre los modos de visualización normal, transparente y alámbrico.
• Captura
  Permite activar o desactivar la referencia a objetos de los elementos.

En la barra de herramientas superior se pueden encontrar las siguientes opciones para gestionar las capas:

• Añadir
  Crea una nueva capa.
• Editar
  Edita la referencia de la capa seleccionada.
• Borrar
  Borra la capa seleccionada.
• Mover un lugar hacia arriba/abajo el elemento seleccionado de la lista
  Mueve la capa seleccionada un lugar arriba o abajo en la lista.
• Asignar capa (Ctrl + A)
  Facilita el cambio del elemento de una capa a otra. El programa permite seleccionar la capa que se desea asignar al elemento.
• Actualizar capas
  Regenera la visualización de todas las capas y las hace visibles.
• Aislar capa
  Permite aislar la capa activa, ocultando las demás capas disponibles en el proyecto.
• Aislar selección (Ctrl + I)
  Permite seleccionar una serie de elementos para que permanezcan visibles; los que no se hayan seleccionado quedarán ocultos.
• Ocultar elementos (Ctrl + H)
  Controla la visibilidad de cada uno de los elementos.
• Mostrar elementos (Ctrl + U)
  Deshace las acciones "Aislar selección" y "Ocultar elementos", mencionadas anteriormente.